MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 115736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008570	GTA	2	6	41069	41074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620171
1002	NC_008570	GAT	2	6	41122	41127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620171
1003	NC_008570	CCAG	2	8	41146	41153	25 %	0 %	25 %	50 %	117620171
1004	NC_008570	TCT	2	6	41192	41197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621457
1005	NC_008570	CTG	2	6	41236	41241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621457
1006	NC_008570	CCA	2	6	41242	41247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621457
1007	NC_008570	GCCG	2	8	41269	41276	0 %	0 %	50 %	50 %	117621457
1008	NC_008570	TCTCTT	2	12	41298	41309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621457
1009	NC_008570	C	6	6	41336	41341	0 %	0 %	0 %	100 %	117621457
1010	NC_008570	CTC	2	6	41362	41367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621457
1011	NC_008570	AGC	2	6	41394	41399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621457
1012	NC_008570	CGCTGG	2	12	41411	41422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117621457
1013	NC_008570	GGC	4	12	41437	41448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621457
1014	NC_008570	CCA	2	6	41478	41483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621457
1015	NC_008570	GGCCAG	2	12	41506	41517	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	117621457
1016	NC_008570	CCA	2	6	41550	41555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621457
1017	NC_008570	CACTG	2	10	41656	41665	20 %	20 %	20 %	40 %	117621457
1018	NC_008570	GATG	2	8	41766	41773	25 %	25 %	50 %	0 %	117621457
1019	NC_008570	CGG	2	6	41784	41789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621457
1020	NC_008570	GGC	2	6	41800	41805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621457
1021	NC_008570	GT	3	6	41925	41930	0 %	50 %	50 %	0 %	117621457
1022	NC_008570	TGCA	2	8	41943	41950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_008570	GCG	2	6	42071	42076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_008570	AGC	2	6	42101	42106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_008570	GGC	2	6	42108	42113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008570	GCC	2	6	42118	42123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_008570	ATG	2	6	42184	42189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621008
1028	NC_008570	TGG	2	6	42212	42217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621008
1029	NC_008570	TGA	2	6	42218	42223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621008
1030	NC_008570	GGC	2	6	42291	42296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1031	NC_008570	TGG	2	6	42328	42333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621008
1032	NC_008570	TGG	2	6	42457	42462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621008
1033	NC_008570	ATG	2	6	42496	42501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621008
1034	NC_008570	GCA	2	6	42522	42527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1035	NC_008570	TCT	2	6	42572	42577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621008
1036	NC_008570	TGC	2	6	42578	42583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1037	NC_008570	GCT	2	6	42593	42598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1038	NC_008570	GGC	2	6	42604	42609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1039	NC_008570	GCG	2	6	42627	42632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1040	NC_008570	CCA	2	6	42635	42640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621008
1041	NC_008570	CAG	2	6	42675	42680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1042	NC_008570	GGC	2	6	42779	42784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1043	NC_008570	CAC	2	6	42792	42797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621008
1044	NC_008570	TGG	2	6	42851	42856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621008
1045	NC_008570	CAC	2	6	42858	42863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621008
1046	NC_008570	TGA	2	6	42905	42910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621008
1047	NC_008570	GCT	2	6	42939	42944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1048	NC_008570	CGG	2	6	43037	43042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1049	NC_008570	ATG	2	6	43051	43056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621008
1050	NC_008570	TCG	2	6	43084	43089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1051	NC_008570	GGTC	2	8	43097	43104	0 %	25 %	50 %	25 %	117621008
1052	NC_008570	CTG	2	6	43143	43148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1053	NC_008570	GGT	2	6	43194	43199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621008
1054	NC_008570	GGC	2	6	43236	43241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1055	NC_008570	AG	3	6	43318	43323	50 %	0 %	50 %	0 %	117621008
1056	NC_008570	CGGGG	2	10	43382	43391	0 %	0 %	80 %	20 %	117621008
1057	NC_008570	T	6	6	43497	43502	0 %	100 %	0 %	0 %	117621008
1058	NC_008570	TTG	2	6	43510	43515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621008
1059	NC_008570	TTC	2	6	43531	43536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621008
1060	NC_008570	TGCC	2	8	43562	43569	0 %	25 %	25 %	50 %	117621008
1061	NC_008570	TGGA	2	8	43597	43604	25 %	25 %	50 %	0 %	117621008
1062	NC_008570	GAT	2	6	43608	43613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621008
1063	NC_008570	GCG	2	6	43635	43640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1064	NC_008570	CG	3	6	43658	43663	0 %	0 %	50 %	50 %	117621008
1065	NC_008570	TTC	2	6	43708	43713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621008
1066	NC_008570	GCG	3	9	43776	43784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1067	NC_008570	TGT	2	6	43817	43822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621008
1068	NC_008570	CCT	2	6	43907	43912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621008
1069	NC_008570	CGT	2	6	44027	44032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1070	NC_008570	GCA	2	6	44033	44038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621008
1071	NC_008570	CGG	2	6	44039	44044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621008
1072	NC_008570	GGGT	2	8	44101	44108	0 %	25 %	75 %	0 %	117621008
1073	NC_008570	CGC	2	6	44120	44125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117621008
1074	NC_008570	CCA	2	6	44159	44164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621008
1075	NC_008570	AAAT	2	8	44235	44242	75 %	25 %	0 %	0 %	117621008
1076	NC_008570	CGGG	2	8	44352	44359	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_008570	GCA	2	6	44406	44411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618766
1078	NC_008570	CAGC	2	8	44416	44423	25 %	0 %	25 %	50 %	117618766
1079	NC_008570	CGG	2	6	44425	44430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618766
1080	NC_008570	TGC	2	6	44442	44447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618766
1081	NC_008570	GTT	2	6	44477	44482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117618766
1082	NC_008570	GGCG	2	8	44575	44582	0 %	0 %	75 %	25 %	117618766
1083	NC_008570	CGG	2	6	44583	44588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618766
1084	NC_008570	GCG	2	6	44589	44594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618766
1085	NC_008570	TACC	2	8	44617	44624	25 %	25 %	0 %	50 %	117618766
1086	NC_008570	TCT	2	6	44637	44642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117618766
1087	NC_008570	A	6	6	44692	44697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008570	GCA	2	6	44759	44764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618161
1089	NC_008570	TTG	2	6	44769	44774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117618161
1090	NC_008570	CTG	4	12	44778	44789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618161
1091	NC_008570	TGA	3	9	44858	44866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618161
1092	NC_008570	GGC	2	6	44960	44965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618161
1093	NC_008570	GGC	2	6	44986	44991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618161
1094	NC_008570	GGCG	2	8	45032	45039	0 %	0 %	75 %	25 %	117618161
1095	NC_008570	CAGG	2	8	45081	45088	25 %	0 %	50 %	25 %	117618161
1096	NC_008570	CG	3	6	45099	45104	0 %	0 %	50 %	50 %	117618161
1097	NC_008570	GTA	2	6	45114	45119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618161
1098	NC_008570	CGC	2	6	45152	45157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618161
1099	NC_008570	GTG	2	6	45238	45243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618161
1100	NC_008570	TGT	2	6	45275	45280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117618161
1101	NC_008570	CGCTC	2	10	45318	45327	0 %	20 %	20 %	60 %	117618161
1102	NC_008570	GAG	2	6	45331	45336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117618161
1103	NC_008570	AG	3	6	45344	45349	50 %	0 %	50 %	0 %	117618161
1104	NC_008570	TTG	2	6	45354	45359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117618161
1105	NC_008570	GCC	2	6	45408	45413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618161
1106	NC_008570	GGC	2	6	45483	45488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618161
1107	NC_008570	A	7	7	45513	45519	100 %	0 %	0 %	0 %	117618161
1108	NC_008570	TGC	2	6	45561	45566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618161
1109	NC_008570	GCC	2	6	45586	45591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618161
1110	NC_008570	CTGC	2	8	45595	45602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_008570	CAG	2	6	45619	45624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_008570	CGG	2	6	45666	45671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619639
1113	NC_008570	GGC	2	6	45703	45708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619639
1114	NC_008570	CCGGT	2	10	45854	45863	0 %	20 %	40 %	40 %	117619639
1115	NC_008570	TGG	2	6	45872	45877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619639
1116	NC_008570	GCC	2	6	45911	45916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619639
1117	NC_008570	TGGG	2	8	45920	45927	0 %	25 %	75 %	0 %	117619639
1118	NC_008570	CCA	2	6	45999	46004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117619639
1119	NC_008570	CGG	2	6	46041	46046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619639
1120	NC_008570	GGCC	2	8	46066	46073	0 %	0 %	50 %	50 %	117619639
1121	NC_008570	CGC	2	6	46074	46079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619639
1122	NC_008570	GCG	2	6	46106	46111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619639
1123	NC_008570	CGG	2	6	46134	46139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619639
1124	NC_008570	GGC	3	9	46165	46173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619639
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1126	NC_008570	TGGT	2	8	46340	46347	0 %	50 %	50 %	0 %	117619639
1127	NC_008570	GCC	2	6	46439	46444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619639
1128	NC_008570	GCA	2	6	46452	46457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619639
1129	NC_008570	GTC	2	6	46604	46609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619639
1130	NC_008570	CCAGCG	2	12	46635	46646	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	117619639
1131	NC_008570	GCA	2	6	46651	46656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619639
1132	NC_008570	GGA	2	6	46690	46695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117619639
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1136	NC_008570	ATGG	3	12	46742	46753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008570	GTTGCC	2	12	46825	46836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_008570	TGAC	3	12	46858	46869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1140	NC_008570	CTG	2	6	46917	46922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619128
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1158	NC_008570	GCA	2	6	47779	47784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620540
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1232	NC_008570	CA	3	6	50979	50984	50 %	0 %	0 %	50 %	117620104
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1236	NC_008570	CTA	2	6	51143	51148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1237	NC_008570	GTC	2	6	51164	51169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1238	NC_008570	TGC	2	6	51271	51276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619911
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1240	NC_008570	GTCA	2	8	51305	51312	25 %	25 %	25 %	25 %	117619911
1241	NC_008570	GGC	2	6	51321	51326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619911
1242	NC_008570	GAC	2	6	51341	51346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619911
1243	NC_008570	TGA	2	6	51357	51362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117619911
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1245	NC_008570	CCGA	2	8	51380	51387	25 %	0 %	25 %	50 %	117619911
1246	NC_008570	GC	3	6	51388	51393	0 %	0 %	50 %	50 %	117619911
1247	NC_008570	GGCC	2	8	51403	51410	0 %	0 %	50 %	50 %	117619911
1248	NC_008570	GCG	2	6	51481	51486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619911
1249	NC_008570	TGG	2	6	51540	51545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619911
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1500	NC_008570	CAG	2	6	62050	62055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621156

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